·评价ULTRARIPA Kit B buffer单独提取脂篱蛋白的能力
(数据提供:东京大学大学院药学系研究科卫生化学教室)
用PBS清洗COS-1细胞后,用SDS buffer、1%Triton X-100 buffer,ULTRARIPA Kit A buffer以及ULTRARIPA Kit B buffer溶解,离心(14,000rpm,5min,4°C)。分离可溶性组分和不溶性组分。不溶性组分用等量的SDS-PAGE sample buffer变性溶解。通过SDS-PAGE/Western印迹评价脂筏标记物中Flotilin 1的可溶解量。在普通1%Triton X-100和RIPA缓中液中,大部分的Flotilin 1保留在不溶性膜组分中,然而在ULTRARIPA Kit B缓冲液中几乎全部溶解了
各缓冲液的成分:
·SDS buffer(2%SDS,1%Triton X-100,50 mM HEPES·Na(pH 7.2),150 mMNaCl)
·UItraRIPA kit A buffer(1%NP-40 Alternative,0.1%SDS,50 mMTris-HCI(pH8.0),150 mMNaCl,
0.5%Sodium Deoxycholate)
·UltraRIPA kit B buffer(成分保密)
·1%Triton X-100(1%Triton X-100,50 mM HEPES·Na(pH 7.2),150 mMNaCl)
·用ULTRARIPA Kit观察NGF刺激依存的Integrin的脂筏转换
(数据提供:国立精神·神经医疗研究中心神经研究所疾病研究第五部)使用的样本:小鼠来源原代培养DRG神经细胞(DIV13,~106 cells/35mm dish)
目标蛋白:Integrin β1,Flotillin 1
步骤:
1.在存在和不存在50ng/mL NGF的情况下培养神经细胞(各准备2个样品)
2.用PBS清洗COS-1细胞后,添加150 uL ULTRARIPA Kit A-buffer,并在冰上孵育
3.离心分离可溶性组分①和不溶性组分
4.准备的2个A-buffer不溶性组分的样品,其中一个管添加150uL 1×SDS sample buffer使其完全溶解②
5.添加150uL B-buffer至另一管A-buffer不溶性组分中,悬浮沉淀物
6.离心并分离B-buffer可溶性组分③和不溶性组分
7.添加150μL 1×SDS-PAGE sample buffer至B-buffer不溶性组分中,使其完全溶解④
结果:
与NGF刺激中未看到Flutillin的波动相比,观察到了Integrinβ1通过NGF浓缩在RIPA不溶性部分中。
·使用ULTRARIPA Kit分析神经突触相关蛋白的可溶性和复合物
(本数据是在Funakoshi与学习院大学理学部高岛明彦教授,住冈晓夫助教共同研究下取得)
■直接添加B-buffer验证溶解效率
使用的样本:小鼠脑组织(海马体+大脑皮质)来源的P2膜组分*
*P2模组分的回收步骤
从小脑组织切除海马体以及大脑皮质,添加匀浆编中液(10 mM HEPES(pH 7.4),0.32 M Sucrose,protease inhibitors)并用Dounce型匀浆器破碎。
低速(×1000g)10分钟离心组织破碎液,去除沉淀的核组分(P1组分)。
上清(S1)组分用中速(×13200g)20分钟进一步离心,去除上清(S2)组分,回收沉淀的膜(P2)。
使用缓冲液条件:
SDS:2%SDS,50 mM Tris-HCI(pH 8.0),150 mM NaCl
19%Triton:1%TritonX-100,50 mM Tris-HCI(pH 8.0),150 mM NaCl
ULTRARIPA Kit A-buffer(RIPA):1%NP-40,0.5%deoxycholate,0.1%SDS,50 mM Tris-HCI(pH 8.0),150 mM NaCl
B-buffer:非公开
步骤:
1.添加各缓中液100mL至P2组分中,在冰上进行超声处理
2.高速(×100,000g)离心破碎液,沉淀不溶性组分,回收各可溶性组分
3.添置100uL 2% SDS缓冲液至各不溶性组分并使其溶解。
结果:
在经过验证的所有神经突触相关蛋白中,ULTRARIPAQ Kit B-buffer的溶解效率t比1%Triton X-100和RIPA编中液(A-buffer)高。
■验证神经细胞膜来源RIPA不溶性组分的B-buffer溶解效率
使用的样本:小鼠脑组织(海马体+大脑皮质)来源的P2膜组分
步骤:
1.添加200µl A-buffer(RIPA)至P2膜组分,在冰上进行超声处理
2.高速(×100,000g)离心破碎液,除去可溶性组分,单独分离不溶性组分。
3.添加200mL 2% SDS,A-buffer或B-buffer至A-buffer不溶性组分,在冰上进行超声处理
4.离心(×100,000g)各溶液,并分离可溶性组分和不溶性组分
5.为了检测B-buffer不溶性组分中残留的蛋白,添加2%SDS至B-buffer组分中使其完全溶解
结果:
发现B-buffer能够溶解神经细胞膜的RIPA不溶性组分中包含的大多数蛋白。
此外,还可以高效提取NMDA型谷氨酸受体亚基的GluN1和GluN2B。
另一方面,尽管PSD 95的可溶性有所提高,但发现它仍残留在B-buffer的不溶性组分中。
·使用ULTRARIPA Kit分析神经突触蛋白复合物
使用的样本:小鼠脑组织(海马体+大脑皮质)来源的P2膜组分
目标:NMDA型谷氨酸受体NMDAR(GluN1/GluN2B)
AMPA型谷氨酸受体AMPAR(GluA1/GluA2)
步骤:
1.添加ULTRARIPA Kit B-buffer至P2膜组分,在冰上进行超声处理;
2.高速离心(×100,000g)破碎液,获取可溶性组分;
3.添加1μg对照lgG或抗GluN2B抗体或GluA2/3抗体至100μL可溶性组分,并在4C下反应1小时后,添加20μL bed vol Protein A磁珠并反应1小时;
4.用PBST(0.05% Tween20 in PBS)清洗磁珠3次;
5.添加1×SDS-PAGE样本缓中液,在100℃加热条件下洗脱。
结果:
使用ULTRARIPA Kit B-buffer,NMDAR,AMPAR都能通过免疫沉淀特异性的检测出复合物。
*SYN(Synaptophysin)